無彩限的幻影世界

21世紀初，轉基因重組設施遭到恐怖襲擊後，特殊病毒開始流出。此後，人類的腦機能開始產生異變，對幽靈妖怪的認識變成可能。人們將這些稱為「幻影Phantom」，與腦機能變異的同時，在這件事情發生前後出生的孩子，有能夠與此對抗的特殊能力者出現。弗塞亞學院的高一的一條晴彥就是其中一人，與能夠操控五行擊敗敵人的前輩川神舞、被稱作幻影殺手擁有特殊能力的和泉玲奈、對幻影要員的候補生孤獨戰鬥的水無瀨小糸一起。以此事件為契機，他們開始了解這個世界的真實...